# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 30 20 4 6 60:35 25 64
2 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 30 18 6 6 45:26 19 53
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 30 16 4 10 50:36 14 52
4 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 30 14 4 12 52:55 -3 46
5 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 30 11 7 12 34:39 -5 40
6 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 30 10 7 13 43:47 -4 37
7 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 30 8 10 12 43:42 1 34
8 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 30 9 7 14 37:41 -4 34
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 30 8 9 13 30:41 -11 33
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 30 3 8 19 22:54 -32 17
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.