| 5. Spieltag | 25.09.2016 | Atromitos | - | Asteras Tripolis | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 03.10.2016 | Xanthi FC | - | Atromitos | 0:0 | ||||
| 9. Spieltag | 29.10.2016 | Atromitos | - | Olympiakos Piraeus | 0:1 |  |
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| 13. Spieltag | 04.12.2016 | AE Lárissa | - | Atromitos | 1:2 | ||||
| 1. Spieltag | 04.01.2017 | AO Kerkyra | - | Atromitos | 1:1 | |
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| 11. Spieltag | 15.01.2017 | Atromitos | - | Panionios GSS | 1:2 | ||||
| 17. Spieltag | 22.01.2017 | Levadiakos | - | Atromitos | 1:1 | ||||
| 18. Spieltag | 29.01.2017 | Atromitos | - | PAS Giannina | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 18.02.2017 | Atromitos | - | Xanthi FC | 2:1 | ||||
| 22. Spieltag | 27.02.2017 | Veria FC | - | Atromitos | 0:1 | ||||
| 23. Spieltag | 05.03.2017 | Atromitos | - | AEP Iraklis FC | 1:0 | |
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| 24. Spieltag | 12.03.2017 | Olympiakos Piraeus | - | Atromitos | 2:0 | ||||
| 25. Spieltag | 18.03.2017 | Atromitos | - | AEK Athen | 0:1 | ||||
| 27. Spieltag | 05.04.2017 | Atromitos | - | PAOK Saloniki | 0:2 | ||||
| 28. Spieltag | 09.04.2017 | Atromitos | - | AE Lárissa | 0:0 | ||||
| 29. Spieltag | 23.04.2017 | Panathinaikos | - | Atromitos | 1:0 | ||||
| 30. Spieltag | 30.04.2017 | Atromitos | - | Platanias Chanion | 4:1 | |
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