| 1. Spieltag | 19.09.2020 | Bayern München II | - | Türkgücü München | 2:2 | ||||
| 2. Spieltag | 26.09.2020 | SC Verl | - | Bayern München II | 3:0 |  |
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| 11. Spieltag | 22.11.2020 | VfB Lübeck | - | Bayern München II | 3:0 |  |
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| 13. Spieltag | 28.11.2020 | Hansa Rostock | - | Bayern München II | 2:0 | ||||
| 15. Spieltag | 13.12.2020 | 1. FC Saarbrücken | - | Bayern München II | 1:2 | ||||
| 16. Spieltag | 16.12.2020 | Bayern München II | - | MSV Duisburg | 1:1 | ||||
| 17. Spieltag | 19.12.2020 | SpVgg Unterhaching | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 07.02.2021 | Bayern München II | - | KFC Uerdingen 05 | 0:1 | ||||
| 24. Spieltag | 13.02.2021 | 1. FC Kaiserslautern | - | Bayern München II | 1:1 | |
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| 22. Spieltag | 24.02.2021 | Dynamo Dresden | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 26. Spieltag | 01.03.2021 | Waldhof Mannheim | - | Bayern München II | 2:2 | ||||
| 21. Spieltag | 10.03.2021 | Bayern München II | - | SC Verl | 1:2 | ||||
| 28. Spieltag | 13.03.2021 | Bayern München II | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 | ||||
| 37. Spieltag | 16.05.2021 | TSV 1860 München | - | Bayern München II | 2:2 | ||||
| 38. Spieltag | 22.05.2021 | Bayern München II | - | Hallescher FC | 0:1 |
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