| 8. Spieltag | 18.10.2008 | FCV Dender EH | - | KRC Genk | 2:4 | ||||
| 10. Spieltag | 01.11.2008 | AFC Tubize | - | KRC Genk | 1:3 | ||||
| 14. Spieltag | 29.11.2008 | KRC Genk | - | Cercle Brugge | 3:2 |  |
|||
| 16. Spieltag | 13.12.2008 | KRC Genk | - | Sporting Charleroi | 1:0 | ||||
| 20. Spieltag | 01.02.2009 | Sporting Lokeren | - | KRC Genk | 1:2 | ||||
| 22. Spieltag | 15.02.2009 | Club Brugge KV | - | KRC Genk | 0:2 | ||||
| 24. Spieltag | 27.02.2009 | KV Mechelen | - | KRC Genk | 2:1 | |
|||
| 25. Spieltag | 07.03.2009 | KRC Genk | - | FCV Dender EH | 4:3 | ||||
| 26. Spieltag | 15.03.2009 | Standard Liège | - | KRC Genk | 2:0 | ||||
| 27. Spieltag | 21.03.2009 | KRC Genk | - | AFC Tubize | 3:0 | ||||
| 28. Spieltag | 04.04.2009 | KRC Genk | - | KVC Westerlo | 1:4 | ||||
| 29. Spieltag | 10.04.2009 | KSV Roeselare | - | KRC Genk | 1:0 | ||||
| 30. Spieltag | 17.04.2009 | KRC Genk | - | KAA Gent | 2:2 | ||||
| 31. Spieltag | 26.04.2009 | Cercle Brugge | - | KRC Genk | 1:2 | ||||
| 32. Spieltag | 03.05.2009 | KRC Genk | - | KV Kortrijk | 0:1 | |
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| 34. Spieltag | 16.05.2009 | KRC Genk | - | RSC Anderlecht | 0:2 |
Belgien