| 1. Spieltag | 16.08.2008 | SC Verl | - | Bayer Leverkusen II | 2:2 |  |
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| 2. Spieltag | 23.08.2008 | Eintracht Trier | - | SC Verl | 0:0 | ||||
| 3. Spieltag | 30.08.2008 | SC Verl | - | SV 07 Elversberg | 0:1 | |
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| 4. Spieltag | 13.09.2008 | BV Cloppenburg | - | SC Verl | 0:1 | ||||
| 5. Spieltag | 20.09.2008 | SC Verl | - | FSV Oggersheim | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 27.09.2008 | Wormatia Worms | - | SC Verl | 1:1 | |
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| 7. Spieltag | 04.10.2008 | SC Verl | - | Borussia Dortmund II | 3:3 | ||||
| 8. Spieltag | 18.10.2008 | Preußen Münster | - | SC Verl | 0:1 | ||||
| 9. Spieltag | 25.10.2008 | SC Verl | - | Sportfreunde Lotte | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 29.10.2008 | Rot-Weiss Essen | - | SC Verl | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 02.11.2008 | SC Verl | - | FC Schalke 04 II | 1:0 | ||||
| 12. Spieltag | 07.11.2008 | 1. FSV Mainz 05 II | - | SC Verl | 2:3 | ||||
| 14. Spieltag | 03.12.2008 | 1. FC Kleve | - | SC Verl | 0:2 | ||||
| 20. Spieltag | 28.02.2009 | SV 07 Elversberg | - | SC Verl | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 07.03.2009 | SC Verl | - | BV Cloppenburg | 4:1 | ||||
| 22. Spieltag | 14.03.2009 | FSV Oggersheim | - | SC Verl | 1:0 | |
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| 23. Spieltag | 21.03.2009 | SC Verl | - | Wormatia Worms | 0:2 | ||||
| 29. Spieltag | 09.05.2009 | SC Verl | - | 1. FSV Mainz 05 II | 0:3 |
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