| Gruppe 2 | 08.02.2006 | Bolívar | - | Estudiantes | 1:0 |  |
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| Gruppe 2 | 22.02.2006 | Estudiantes | - | Sporting Cristal | 4:3 | ||||
| Gruppe 2 | 10.03.2006 | Santa Fe | - | Estudiantes | 3:1 | ||||
| Gruppe 2 | 21.03.2006 | Estudiantes | - | Santa Fe | 1:0 | ||||
| Gruppe 2 | 05.04.2006 | Sporting Cristal | - | Estudiantes | 2:2 | ||||
| Gruppe 2 | 14.04.2006 | Estudiantes | - | Bolívar | 2:1 | ||||
| Achtelfinale | 26.04.2006 | Estudiantes | - | Goiás - GO | 2:0 | ||||
| Achtelfinale | 05.05.2006 | Goiás - GO | - | Estudiantes | 3:1 | ||||
| Viertelfinale | 11.05.2006 | Estudiantes | - | São Paulo FC | 1:0 | ||||
| Viertelfinale | 20.07.2006 | São Paulo FC | - | Estudiantes | 4:3 i.E. |
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