# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 20 13 4 3 40:25 15 43
2 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 20 11 2 7 39:33 6 35
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 20 10 4 6 34:23 11 34
4 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 20 12 3 5 27:20 7 32
5 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 20 7 4 9 25:25 0 25
6 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 20 6 6 8 33:36 -3 24
7 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 20 6 6 8 19:24 -5 24
8 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 20 5 6 9 28:29 -1 21
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 20 4 7 9 19:29 -10 19
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 20 2 6 12 14:34 -20 12
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.