# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 21 13 4 4 41:27 14 43
2 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 21 12 2 7 42:35 7 38
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 21 11 4 6 36:24 12 37
4 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 21 13 3 5 28:20 8 35
5 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 21 7 6 8 35:37 -2 27
6 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 21 7 6 8 21:25 -4 27
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 21 7 4 10 26:27 -1 25
8 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 21 5 6 10 29:31 -2 21
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 21 4 7 10 19:30 -11 19
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 21 2 6 13 16:37 -21 12
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.