# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 22 14 4 4 44:28 16 46
2 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 22 12 2 8 44:38 6 38
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 22 11 4 7 37:27 10 37
4 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 22 13 4 5 28:20 8 36
5 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 22 8 4 10 29:29 0 28
6 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 22 7 6 9 35:38 -3 27
7 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 22 7 6 9 21:28 -7 27
8 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 22 6 6 10 30:31 -1 24
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 22 5 7 10 22:30 -8 22
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 22 2 7 13 16:37 -21 13
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.