# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 23 14 4 5 44:29 15 46
2 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 23 13 2 8 45:38 7 41
3 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 23 14 4 5 29:20 9 39
4 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 23 11 4 8 37:28 9 37
5 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 23 8 6 9 36:38 -2 30
6 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 23 8 6 9 23:29 -6 30
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 23 8 4 11 30:31 -1 28
8 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 23 7 6 10 32:31 1 27
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 23 5 7 11 22:32 -10 22
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 23 2 7 14 16:38 -22 13
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.