# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 23 10 12 1 15:5 10 42
2 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 23 10 9 4 20:15 5 39
3 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 23 10 8 5 18:13 5 38
4 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 23 10 6 6 17:10 7 36
5 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 23 6 11 6 12:10 2 29
6 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 23 7 8 7 17:12 5 29
7 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 23 4 10 8 7:14 -7 22
8 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 23 3 13 7 6:13 -7 22
9 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 23 4 8 11 12:22 -10 20
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 23 3 7 12 5:15 -10 16
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.