# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 22 9 12 1 14:5 9 39
2 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 22 10 8 4 18:12 6 38
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 22 10 8 4 20:15 5 38
4 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 22 9 6 6 16:10 6 33
5 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 22 6 10 6 12:10 2 28
6 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 22 7 7 7 17:12 5 28
7 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 22 4 10 7 7:13 -6 22
8 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 22 3 12 7 6:13 -7 21
9 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 22 4 7 11 12:22 -10 19
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 22 3 6 12 5:15 -10 15
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.