# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 21 9 11 1 14:5 9 38
2 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 21 10 7 4 17:11 6 37
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 21 10 7 4 19:14 5 37
4 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 21 8 6 6 15:10 5 30
5 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 21 6 9 6 11:9 2 27
6 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 21 7 6 7 16:11 5 27
7 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 21 4 9 7 7:13 -6 21
8 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 21 3 11 7 6:13 -7 20
9 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 21 4 7 10 12:21 -9 19
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 21 3 5 12 5:15 -10 14
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.