# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 35 22 7 6 41:21 20 73
2 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 35 14 15 6 26:21 5 57
3 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 35 14 10 11 36:25 11 52
4 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 35 14 10 11 34:23 11 52
5 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 35 11 16 8 32:25 7 49
6 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 35 11 8 15 34:41 -7 41
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 35 10 10 15 25:31 -6 40
8 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 35 8 12 14 20:26 -6 36
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 35 8 9 17 18:32 -14 33
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 35 6 13 15 18:39 -21 31
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.