# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 35 24 5 6 73:37 36 77
2 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 35 21 8 6 59:33 26 64
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 35 19 5 11 60:41 19 62
4 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 35 14 6 15 57:65 -8 48
5 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 35 13 8 14 40:46 -6 47
6 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 35 12 8 15 54:57 -3 44
7 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 35 10 11 14 48:47 1 41
8 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 35 9 11 15 36:55 -19 38
9 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 35 10 7 18 41:50 -9 37
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 35 4 9 22 30:67 -37 21
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.