| 2. Spieltag | 08.08.2009 | SV Zulte Waregem | - | KRC Genk | 2:2 |  |
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| 3. Spieltag | 15.08.2009 | KRC Genk | - | KAA Gent | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 23.08.2009 | KVC Westerlo | - | KRC Genk | 0:1 | ||||
| 5. Spieltag | 30.08.2009 | KRC Genk | - | Germinal Beerschot | 1:1 | ||||
| 7. Spieltag | 18.09.2009 | KRC Genk | - | Sporting Charleroi | 1:2 | ||||
| 8. Spieltag | 22.09.2009 | Sint-Truidense VV | - | KRC Genk | 2:4 | ||||
| 9. Spieltag | 26.09.2009 | KRC Genk | - | KSV Roeselare | 1:1 | ||||
| 13. Spieltag | 02.11.2009 | KRC Genk | - | Cercle Brugge | 2:0 | ||||
| 16. Spieltag | 28.11.2009 | Excelsior Mouscron | - | KRC Genk | annull. | |
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| 20. Spieltag | 26.12.2009 | Germinal Beerschot | - | KRC Genk | 1:0 | |
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| 21. Spieltag | 29.12.2009 | KRC Genk | - | Sint-Truidense VV | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 24.01.2010 | KRC Genk | - | Club Brugge KV | 2:0 | ||||
| 27. Spieltag | 19.02.2010 | KRC Genk | - | Sporting Lokeren | 3:1 | |
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| 26. Spieltag | 07.03.2010 | KV Mechelen | - | KRC Genk | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 21.03.2010 | KRC Genk | - | KV Kortrijk | 1:1 | |
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