| 7. Spieltag | 18.09.2012 | AFC Wimbledon | - | Torquay United | 0:1 | ||||
| 8. Spieltag | 22.09.2012 | Wycombe Wanderers | - | AFC Wimbledon | 0:1 | ||||
| 9. Spieltag | 29.09.2012 | AFC Wimbledon | - | Accrington Stanley | 1:2 | ||||
| 10. Spieltag | 02.10.2012 | Oxford United | - | AFC Wimbledon | 3:2 | ||||
| 17. Spieltag | 10.11.2012 | York City | - | AFC Wimbledon | 0:3 | ||||
| 18. Spieltag | 17.11.2012 | AFC Wimbledon | - | Aldershot Town | 1:1 |  |
|||
| 19. Spieltag | 20.11.2012 | AFC Wimbledon | - | Southend United | 0:4 | ||||
| 20. Spieltag | 24.11.2012 | Morecambe FC | - | AFC Wimbledon | 3:1 | ||||
| 21. Spieltag | 08.12.2012 | Barnet FC | - | AFC Wimbledon | 1:1 | ||||
| 36. Spieltag | 02.03.2013 | Cheltenham Town | - | AFC Wimbledon | 2:1 | ||||
| 42. Spieltag | 01.04.2013 | AFC Wimbledon | - | Barnet FC | 0:1 | ||||
| 44. Spieltag | 13.04.2013 | AFC Wimbledon | - | Exeter City | 2:2 | ||||
| 45. Spieltag | 20.04.2013 | Gillingham FC | - | AFC Wimbledon | 2:2 | ||||
| 46. Spieltag | 27.04.2013 | AFC Wimbledon | - | Fleetwood Town | 2:1 | |
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