| 15. Spieltag | 22.10.2016 | Peterborough United | - | AFC Wimbledon | 0:1 | ||||
| 17. Spieltag | 12.11.2016 | Oldham Athletic | - | AFC Wimbledon | 0:0 | ||||
| 18. Spieltag | 19.11.2016 | AFC Wimbledon | - | Bury FC | 5:1 | ||||
| 19. Spieltag | 22.11.2016 | Millwall FC | - | AFC Wimbledon | 0:0 | ||||
| 20. Spieltag | 26.11.2016 | AFC Wimbledon | - | Fleetwood Town | 2:2 | ||||
| 21. Spieltag | 10.12.2016 | Milton Keynes Dons | - | AFC Wimbledon | 1:0 | ||||
| 22. Spieltag | 17.12.2016 | AFC Wimbledon | - | Port Vale FC | 4:0 |  |
|||
| 23. Spieltag | 26.12.2016 | Southend United | - | AFC Wimbledon | 3:0 | ||||
| 24. Spieltag | 31.12.2016 | Bristol Rovers | - | AFC Wimbledon | 2:0 | ||||
| 28. Spieltag | 21.01.2017 | Chesterfield FC | - | AFC Wimbledon | 0:0 | ||||
| 31. Spieltag | 11.02.2017 | AFC Wimbledon | - | Charlton Athletic | 1:1 |  |
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| 32. Spieltag | 14.02.2017 | AFC Wimbledon | - | Coventry City | 1:1 | ||||
| 37. Spieltag | 11.03.2017 | AFC Wimbledon | - | Northampton Town | 0:1 |
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