| Gruppe 2 | 23.02.2000 | Blooming | - | Boca Juniors | 1:0 |  |
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| Gruppe 2 | 16.03.2000 | Peñarol | - | Boca Juniors | 0:0 | ||||
| Gruppe 2 | 22.03.2000 | Boca Juniors | - | Blooming | 6:1 |  |
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| Gruppe 2 | 12.04.2000 | Universidad Católica | - | Boca Juniors | 1:3 | ||||
| Gruppe 2 | 19.04.2000 | Boca Juniors | - | Peñarol | 3:1 | ||||
| Achtelfinale | 03.05.2000 | El Nacional | - | Boca Juniors | 0:0 | ||||
| Achtelfinale | 09.05.2000 | Boca Juniors | - | El Nacional | 5:3 | ||||
| Viertelfinale | 17.05.2000 | River Plate | - | Boca Juniors | 2:1 |  |
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| Viertelfinale | 24.05.2000 | Boca Juniors | - | River Plate | 3:0 | |
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| Halbfinale | 31.05.2000 | Boca Juniors | - | CF América | 4:1 | |
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| Halbfinale | 07.06.2000 | CF América | - | Boca Juniors | 3:1 | |
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| Finale | 14.06.2000 | Boca Juniors | - | Palmeiras | 2:2 | |
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| Finale | 21.06.2000 | Palmeiras | - | Boca Juniors | 2:4 i.E. |
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