| 3. Spieltag | 29.07.2016 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | 1. FC Nürnberg II | 1:2 |  |
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| 4. Spieltag | 02.08.2016 | 1. FC Nürnberg II | - | SpVgg Bayern Hof | 3:2 | ||||
| 8. Spieltag | 28.08.2016 | TSV Buchbach | - | 1. FC Nürnberg II | 2:5 | ||||
| 9. Spieltag | 03.09.2016 | 1. FC Nürnberg II | - | SpVgg Unterhaching | 1:4 | ||||
| 10. Spieltag | 11.09.2016 | FC Ingolstadt 04 II | - | 1. FC Nürnberg II | 0:3 | ||||
| 11. Spieltag | 16.09.2016 | 1. FC Nürnberg II | - | SpVgg Bayreuth | 0:5 |  |
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| 14. Spieltag | 08.10.2016 | VfR Garching | - | 1. FC Nürnberg II | 3:4 | |
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| 15. Spieltag | 15.10.2016 | 1. FC Nürnberg II | - | FC Memmingen | 2:2 | |
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| 16. Spieltag | 23.10.2016 | SpVgg Greuther Fürth II | - | 1. FC Nürnberg II | 0:1 | ||||
| 18. Spieltag | 05.11.2016 | 1. FC Nürnberg II | - | FC Augsburg II | 1:4 | ||||
| 19. Spieltag | 12.11.2016 | SV Schalding-Heining | - | 1. FC Nürnberg II | 4:3 | |
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| 20. Spieltag | 19.11.2016 | SpVgg Bayern Hof | - | 1. FC Nürnberg II | 2:5 | ||||
| 21. Spieltag | 26.11.2016 | FV Illertissen | - | 1. FC Nürnberg II | 2:0 | |
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| 25. Spieltag | 25.03.2017 | 1. FC Nürnberg II | - | TSV Buchbach | 3:3 |
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