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| 18.11.2016 | 19:00 | Bayern München II | - | TSV Buchbach | 4:0 (3:0) | |
| 19:00 | FC Augsburg II | - | Wacker Burghausen | 0:1 (0:1) | ||
| 19.11.2016 | 13:00 | VfR Garching | - | SpVgg Bayreuth | 1:2 (1:1) | |
| 14:00 | FC Memmingen | - | FC Ingolstadt 04 II | 3:0 (1:0) | ||
| 14:00 | SpVgg Greuther Fürth II | - | SpVgg Unterhaching | 0:3 (0:1) | ||
| 14:00 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | FV Illertissen | 1:0 (0:0) | ||
| 14:00 | SpVgg Bayern Hof | - | 1. FC Nürnberg II | 2:5 (2:2) | ||
| 14:00 | TSV 1860 Rosenheim | - | TSV 1860 München II | 2:0 (1:0) | ||
| 04.04.2017 | 18:00 | SV Schalding-Heining | - | SV Seligenporten | 1:0 (0:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
SpVgg Unterhaching | 20 | 17 | 3 | 0 | 65:10 | 55 | 54 |
| 2 |
|
Bayern München II | 20 | 10 | 8 | 2 | 33:19 | 14 | 38 |
| 3 |
|
FC Augsburg II | 20 | 9 | 8 | 3 | 43:20 | 23 | 35 |
| 4 |
|
1. FC Nürnberg II | 20 | 9 | 5 | 6 | 48:43 | 5 | 32 |
| 5 |
|
VfR Garching | 20 | 10 | 2 | 8 | 39:42 | -3 | 32 |
| 6 |
|
FC Memmingen | 20 | 8 | 6 | 6 | 40:27 | 13 | 30 |
| 7 |
|
1. FC Schweinfurt 05 | 20 | 9 | 3 | 8 | 37:34 | 3 | 30 |
| 8 |
|
Wacker Burghausen | 20 | 8 | 5 | 7 | 29:28 | 1 | 29 |
| 9 |
|
SpVgg Bayreuth | 20 | 8 | 4 | 8 | 36:34 | 2 | 28 |
| 10 |
|
FV Illertissen | 20 | 8 | 2 | 10 | 25:32 | -7 | 26 |
| 11 |
|
SpVgg Greuther Fürth II | 20 | 6 | 4 | 10 | 25:30 | -5 | 22 |
| 12 |
|
TSV 1860 Rosenheim | 20 | 6 | 4 | 10 | 23:31 | -8 | 22 |
| 13 |
|
FC Ingolstadt 04 II | 20 | 4 | 9 | 7 | 28:38 | -10 | 21 |
| 14 |
|
SV Schalding-Heining | 20 | 4 | 7 | 9 | 28:40 | -12 | 19 |
| 15 |
|
SV Seligenporten | 20 | 5 | 4 | 11 | 26:48 | -22 | 19 |
| 16 |
|
TSV Buchbach | 20 | 5 | 3 | 12 | 24:45 | -21 | 18 |
| 17 |
|
SpVgg Bayern Hof | 20 | 2 | 3 | 15 | 24:54 | -30 | 9 |
| 18 |
|
TSV 1860 München II | 20 | 9 | 6 | 5 | 0:0 | -8 | -30 |
| Playoffs | |
| Relegation | |
| Abstieg |
|
# Der TSV 1860 München II steigt gemäß den Statuten des Verbands automatisch in die Bayernliga ab, da die Profimannschaft des Vereins aus der 2. Bundesliga absteigt. Der SV Seligenporten vermeidet damit den direkten Abstieg und spielt in der Relegation, Schalding-Heining ist gerettet. |
