| Gruppe 3 | 25.02.2016 | Deportivo Cali | - | Boca Juniors | 0:0 | ||||
| Gruppe 3 | 03.03.2016 | Boca Juniors | - | Racing Club | 0:0 |  |
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| Gruppe 3 | 11.03.2016 | Bolívar | - | Boca Juniors | 1:1 | ||||
| Gruppe 3 | 08.04.2016 | Boca Juniors | - | Bolívar | 3:1 | |
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| Gruppe 3 | 14.04.2016 | Racing Club | - | Boca Juniors | 0:1 | |
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| Achtelfinale | 29.04.2016 | Cerro Porteño | - | Boca Juniors | 1:2 | ||||
| Achtelfinale | 06.05.2016 | Boca Juniors | - | Cerro Porteño | 3:1 | |
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| Viertelfinale | 13.05.2016 | Nacional | - | Boca Juniors | 1:1 | ||||
| Viertelfinale | 20.05.2016 | Boca Juniors | - | Nacional | 4:3 i.E. | |
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| Halbfinale | 08.07.2016 | Independiente del Valle | - | Boca Juniors | 2:1 | ||||
| Halbfinale | 15.07.2016 | Boca Juniors | - | Independiente del Valle | 2:3 |
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