| 19. Spieltag | 28.01.2006 | SC Freiburg | - | Dynamo Dresden | 1:0 | ||||
| 20. Spieltag | 05.02.2006 | Erzgebirge Aue | - | SC Freiburg | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 12.02.2006 | SC Freiburg | - | Kickers Offenbach | 2:0 | ||||
| 22. Spieltag | 17.02.2006 | Karlsruher SC | - | SC Freiburg | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 27.02.2006 | SC Freiburg | - | TSV 1860 München | 2:1 | ||||
| 25. Spieltag | 12.03.2006 | SC Freiburg | - | Eintracht Braunschweig | 1:0 | ||||
| 24. Spieltag | 16.03.2006 | SpVgg Unterhaching | - | SC Freiburg | 1:0 | ||||
| 26. Spieltag | 19.03.2006 | 1. FC Saarbrücken | - | SC Freiburg | 2:1 | ||||
| 27. Spieltag | 27.03.2006 | SC Freiburg | - | VfL Bochum | 0:0 | ||||
| 28. Spieltag | 31.03.2006 | Energie Cottbus | - | SC Freiburg | 2:1 | ||||
| 29. Spieltag | 09.04.2006 | SC Freiburg | - | SC Paderborn 07 | 1:0 |  |
|||
| 30. Spieltag | 16.04.2006 | LR Ahlen | - | SC Freiburg | 0:0 | |
|||
| 31. Spieltag | 23.04.2006 | SC Freiburg | - | Sportfreunde Siegen | 2:2 | ||||
| 32. Spieltag | 03.05.2006 | Hansa Rostock | - | SC Freiburg | 1:2 |  |
|||
| 33. Spieltag | 07.05.2006 | Alemannia Aachen | - | SC Freiburg | 0:1 | ||||
| 34. Spieltag | 14.05.2006 | SC Freiburg | - | SpVgg Greuther Fürth | 1:0 | |
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