| 29. Spieltag | 28.01.2017 | Northampton Town | - | Coventry City | 3:0 |  |
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| 30. Spieltag | 04.02.2017 | Walsall FC | - | Northampton Town | 2:1 | ||||
| 31. Spieltag | 11.02.2017 | Northampton Town | - | Chesterfield FC | 3:1 | ||||
| 32. Spieltag | 14.02.2017 | Northampton Town | - | Swindon Town | 2:1 | ||||
| 34. Spieltag | 25.02.2017 | Fleetwood Town | - | Northampton Town | 3:0 | ||||
| 35. Spieltag | 28.02.2017 | Northampton Town | - | Oldham Athletic | 1:2 | ||||
| 37. Spieltag | 11.03.2017 | AFC Wimbledon | - | Northampton Town | 0:1 | ||||
| 38. Spieltag | 14.03.2017 | Northampton Town | - | Port Vale FC | 2:1 | ||||
| 39. Spieltag | 18.03.2017 | Bolton Wanderers | - | Northampton Town | 2:1 | ||||
| 40. Spieltag | 25.03.2017 | Northampton Town | - | Oxford United | 0:0 | ||||
| 43. Spieltag | 14.04.2017 | Millwall FC | - | Northampton Town | 3:0 | ||||
| 45. Spieltag | 22.04.2017 | Bury FC | - | Northampton Town | 3:0 | ||||
| 46. Spieltag | 30.04.2017 | Northampton Town | - | Gillingham FC | 0:0 |
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