| 1. Runde | 18.09.2008 | CS Marítimo | - | Valencia CF | 0:1 | ||||
| 1. Runde | 02.10.2008 | Valencia CF | - | CS Marítimo | 2:1 | ||||
| Gruppe G | 06.11.2008 | Valencia CF | - | FC København | 1:1 | ||||
| Gruppe G | 27.11.2008 | Rosenborg BK | - | Valencia CF | 0:4 | ||||
| Gruppe G | 04.12.2008 | Valencia CF | - | Club Brugge KV | 1:1 | ||||
| Gruppe G | 17.12.2008 | AS Saint-Étienne | - | Valencia CF | 2:2 | ||||
| 3. Runde | 18.02.2009 | Dinamo Kiev | - | Valencia CF | 1:1 | ||||
| 3. Runde | 26.02.2009 | Valencia CF | - | Dinamo Kiev | 2:2 |
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