| 6. Spieltag | 14.09.2008 | 1. FC Brno | - | AC Sparta Praha | 0:2 | ||||
| 7. Spieltag | 21.09.2008 | Sigma Olomouc | - | 1. FC Brno | 1:1 | ||||
| 8. Spieltag | 28.09.2008 | 1. FC Brno | - | SK Kladno | 2:0 | ||||
| 9. Spieltag | 05.10.2008 | FK Baumit Jablonec | - | 1. FC Brno | 2:0 | ||||
| 10. Spieltag | 19.10.2008 | Viktoria Žižkov | - | 1. FC Brno | 1:1 | ||||
| 11. Spieltag | 26.10.2008 | 1. FC Brno | - | Dynamo České Budějovice | 1:1 | ||||
| 14. Spieltag | 17.11.2008 | FK Teplice | - | 1. FC Brno | 1:0 | ||||
| 15. Spieltag | 23.11.2008 | 1. FC Brno | - | Tescoma Zlín | 3:0 | ||||
| 17. Spieltag | 22.02.2009 | 1. FC Brno | - | Baník Ostrava | 2:0 | ||||
| 18. Spieltag | 02.03.2009 | FK Mladá Boleslav | - | 1. FC Brno | 2:4 | ||||
| 19. Spieltag | 08.03.2009 | 1. FC Brno | - | Bohemians Praha | 0:0 | ||||
| 20. Spieltag | 16.03.2009 | AC Sparta Praha | - | 1. FC Brno | 4:0 | ||||
| 21. Spieltag | 22.03.2009 | 1. FC Brno | - | Sigma Olomouc | 1:2 |
Tschechien