| 1. Spieltag | 10.08.2009 | Arminia Bielefeld | - | Hansa Rostock | 3:1 | ||||
| 2. Spieltag | 15.08.2009 | Hansa Rostock | - | TSV 1860 München | 2:1 | ||||
| 9. Spieltag | 17.10.2009 | Hansa Rostock | - | SC Paderborn 07 | 1:2 | ||||
| 10. Spieltag | 24.10.2009 | MSV Duisburg | - | Hansa Rostock | 3:1 | ||||
| 12. Spieltag | 09.11.2009 | Alemannia Aachen | - | Hansa Rostock | 1:0 | ||||
| 14. Spieltag | 27.11.2009 | FSV Frankfurt | - | Hansa Rostock | 0:1 | ||||
| 20. Spieltag | 24.02.2010 | Hansa Rostock | - | 1. FC Union Berlin | 0:0 | ||||
| 24. Spieltag | 27.02.2010 | SpVgg Greuther Fürth | - | Hansa Rostock | 1:0 | ||||
| 25. Spieltag | 05.03.2010 | Hansa Rostock | - | Rot Weiss Ahlen | 0:1 | ||||
| 26. Spieltag | 14.03.2010 | SC Paderborn 07 | - | Hansa Rostock | 2:2 | ||||
| 27. Spieltag | 19.03.2010 | Hansa Rostock | - | MSV Duisburg | 3:1 |  |
|||
| 28. Spieltag | 28.03.2010 | FC St. Pauli | - | Hansa Rostock | 2:0 | ||||
| 29. Spieltag | 04.04.2010 | Hansa Rostock | - | Alemannia Aachen | 2:0 | ||||
| 30. Spieltag | 11.04.2010 | Karlsruher SC | - | Hansa Rostock | 2:1 | ||||
| 31. Spieltag | 17.04.2010 | Hansa Rostock | - | FSV Frankfurt | 1:2 |
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