| 12. Spieltag | 29.10.2016 | FK Amkar Perm | - | FK Rostov | 1:0 |  |
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| 13. Spieltag | 06.11.2016 | CSKA Moskva | - | FK Amkar Perm | 2:2 | ||||
| 14. Spieltag | 20.11.2016 | Spartak Moskva | - | FK Amkar Perm | 1:0 | ||||
| 15. Spieltag | 26.11.2016 | FK Amkar Perm | - | Arsenal Tula | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 01.12.2016 | Anzhi Makhachkala | - | FK Amkar Perm | 3:1 | ||||
| 18. Spieltag | 05.03.2017 | FK Ural | - | FK Amkar Perm | 1:0 | |
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| 19. Spieltag | 12.03.2017 | FK Amkar Perm | - | Zenit St. Petersburg | 1:0 | ||||
| 20. Spieltag | 18.03.2017 | FK Tom Tomsk | - | FK Amkar Perm | 1:0 | |
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| 21. Spieltag | 02.04.2017 | FK Amkar Perm | - | Terek Grozny | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 08.04.2017 | Krylia Sovetov | - | FK Amkar Perm | 2:2 | ||||
| 23. Spieltag | 15.04.2017 | FK Amkar Perm | - | FK Ufa | 1:1 | ||||
| 24. Spieltag | 22.04.2017 | Lokomotiv Moskva | - | FK Amkar Perm | 3:3 | ||||
| 25. Spieltag | 27.04.2017 | FK Amkar Perm | - | FK Krasnodar | 0:2 | ||||
| 26. Spieltag | 30.04.2017 | FK Rostov | - | FK Amkar Perm | 1:0 | ||||
| 27. Spieltag | 06.05.2017 | FK Amkar Perm | - | CSKA Moskva | 0:2 | |
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| 29. Spieltag | 17.05.2017 | Arsenal Tula | - | FK Amkar Perm | 0:0 |
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