| 17. Spieltag | 21.01.2025 | Fleetwood Town | - | Milton Keynes Dons | 2:1 |  |
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| 29. Spieltag | 28.01.2025 | Milton Keynes Dons | - | Harrogate Town | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 01.02.2025 | Doncaster Rovers | - | Milton Keynes Dons | 2:1 | ||||
| 31. Spieltag | 08.02.2025 | Milton Keynes Dons | - | Bromley FC | 0:1 |  |
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| 19. Spieltag | 11.02.2025 | Barrow AFC | - | Milton Keynes Dons | 2:1 | ||||
| 33. Spieltag | 22.02.2025 | Bradford City | - | Milton Keynes Dons | 2:0 | ||||
| 34. Spieltag | 01.03.2025 | Milton Keynes Dons | - | Colchester United | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 08.03.2025 | Milton Keynes Dons | - | Morecambe FC | 2:1 | ||||
| 37. Spieltag | 15.03.2025 | Port Vale FC | - | Milton Keynes Dons | 3:0 | |
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| 26. Spieltag | 25.03.2025 | Carlisle United | - | Milton Keynes Dons | 2:2 | ||||
| 39. Spieltag | 29.03.2025 | Milton Keynes Dons | - | Fleetwood Town | 2:4 | ||||
| 41. Spieltag | 05.04.2025 | Milton Keynes Dons | - | Barrow AFC | 0:3 | |
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| 42. Spieltag | 12.04.2025 | Gillingham FC | - | Milton Keynes Dons | 1:0 | ||||
| 43. Spieltag | 18.04.2025 | Milton Keynes Dons | - | Newport County | 0:0 | |
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| 45. Spieltag | 26.04.2025 | Milton Keynes Dons | - | Grimsby Town | 0:0 |
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