# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 25 12 12 1 19:5 14 48
2 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 25 12 9 4 24:16 8 45
3 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 25 12 8 5 21:14 7 44
4 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 25 12 6 6 21:12 9 42
5 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 25 6 11 8 14:15 -1 29
6 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 25 7 8 9 17:15 2 29
7 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 25 4 13 8 10:16 -6 25
8 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 25 4 11 9 8:16 -8 23
9 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 25 4 9 12 12:24 -12 21
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 25 3 7 14 6:19 -13 16
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.