# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 25 15 6 4 29:16 13 51
2 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 25 11 7 7 26:19 7 40
3 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 25 8 12 5 17:17 0 36
4 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 25 10 5 9 29:29 0 35
5 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 25 9 7 9 20:15 5 34
6 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 25 8 10 7 20:16 4 34
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 25 9 7 9 20:21 -1 34
8 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 25 5 9 10 15:20 -5 24
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 25 5 7 12 13:19 -6 22
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 25 3 10 11 8:25 -17 19
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.