# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 12 8 2 2 26:13 13 26
2 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 12 8 2 2 21:10 11 26
3 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 12 8 1 3 25:14 11 25
4 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 13 7 2 4 28:18 10 23
5 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 13 6 2 5 21:16 5 20
6 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 12 5 4 3 23:14 9 19
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 12 5 4 3 20:12 8 19
8 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 13 5 2 6 16:19 -3 17
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 13 2 7 4 10:13 -3 13
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 13 2 1 10 9:27 -18 7
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.