| 29. Spieltag | 04.02.2017 | Doncaster Rovers | - | Morecambe FC | 1:1 | ||||
| 30. Spieltag | 11.02.2017 | Morecambe FC | - | Cambridge United | 2:0 | ||||
| 32. Spieltag | 18.02.2017 | Crawley Town | - | Morecambe FC | 1:3 |  |
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| 20. Spieltag | 21.02.2017 | Newport County | - | Morecambe FC | 1:1 | ||||
| 33. Spieltag | 25.02.2017 | Morecambe FC | - | Grimsby Town | 1:0 | ||||
| 35. Spieltag | 04.03.2017 | Blackpool FC | - | Morecambe FC | 3:1 |  |
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| 36. Spieltag | 11.03.2017 | Morecambe FC | - | Yeovil Town | 1:3 | |
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| 37. Spieltag | 14.03.2017 | Morecambe FC | - | Newport County | 0:1 | ||||
| 39. Spieltag | 25.03.2017 | Morecambe FC | - | Mansfield Town | 1:3 | ||||
| 40. Spieltag | 01.04.2017 | Cheltenham Town | - | Morecambe FC | 3:1 | ||||
| 41. Spieltag | 08.04.2017 | Morecambe FC | - | Hartlepool United | 1:1 | ||||
| 43. Spieltag | 17.04.2017 | Morecambe FC | - | Colchester United | 1:1 | ||||
| 44. Spieltag | 22.04.2017 | Exeter City | - | Morecambe FC | 3:1 | ||||
| 46. Spieltag | 06.05.2017 | Luton Town | - | Morecambe FC | 3:1 |
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