| 31. Spieltag | 27.01.2024 | Chesterfield FC | - | Southend United | 3:0 | ||||
| 32. Spieltag | 03.02.2024 | Southend United | - | Gateshead FC | 0:1 | ||||
| 33. Spieltag | 10.02.2024 | Southend United | - | York City | 0:1 | ||||
| 35. Spieltag | 20.02.2024 | Maidenhead United | - | Southend United | 1:2 |  |
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| 36. Spieltag | 24.02.2024 | Southend United | - | Aldershot Town | 4:1 | ||||
| 29. Spieltag | 27.02.2024 | Southend United | - | Altrincham FC | 2:1 | ||||
| 37. Spieltag | 02.03.2024 | Oldham Athletic | - | Southend United | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 05.03.2024 | Southend United | - | Wealdstone FC | 1:1 | ||||
| 38. Spieltag | 09.03.2024 | Southend United | - | Dagenham & Redbridge | 1:1 | |
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| 39. Spieltag | 12.03.2024 | Southend United | - | Dorking Wanderers | 2:0 | ||||
| 41. Spieltag | 23.03.2024 | Southend United | - | Woking FC | 0:0 | ||||
| 43. Spieltag | 01.04.2024 | Southend United | - | Boreham Wood | 4:2 | ||||
| 30. Spieltag | 09.04.2024 | Wealdstone FC | - | Southend United | 1:2 | ||||
| 45. Spieltag | 13.04.2024 | AFC Fylde | - | Southend United | 0:2 | |
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| 46. Spieltag | 20.04.2024 | Southend United | - | Rochdale AFC | 1:2 |
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