| 30. Spieltag | 26.01.2013 | Gillingham FC | - | York City | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 02.02.2013 | York City | - | Morecambe FC | 1:4 | ||||
| 32. Spieltag | 09.02.2013 | Wycombe Wanderers | - | York City | 4:0 | ||||
| 23. Spieltag | 12.02.2013 | York City | - | Gillingham FC | 0:0 | ||||
| 33. Spieltag | 16.02.2013 | York City | - | Barnet FC | 1:2 | ||||
| 34. Spieltag | 23.02.2013 | Oxford United | - | York City | 0:0 |  |
|||
| 35. Spieltag | 26.02.2013 | Rotherham United | - | York City | 1:1 | |
|||
| 36. Spieltag | 02.03.2013 | York City | - | Bradford City | 0:2 | ||||
| 37. Spieltag | 09.03.2013 | AFC Wimbledon | - | York City | 3:2 | ||||
| 38. Spieltag | 12.03.2013 | York City | - | Rochdale AFC | 0:0 | ||||
| 39. Spieltag | 16.03.2013 | York City | - | Port Vale FC | 0:2 | ||||
| 40. Spieltag | 23.03.2013 | Torquay United | - | York City | 2:1 | ||||
| 41. Spieltag | 30.03.2013 | Bristol Rovers | - | York City | 0:0 | ||||
| 42. Spieltag | 01.04.2013 | York City | - | Plymouth Argyle | 2:0 | ||||
| 43. Spieltag | 06.04.2013 | York City | - | Accrington Stanley | 1:1 | ||||
| 44. Spieltag | 13.04.2013 | Northampton Town | - | York City | 0:2 | ||||
| 45. Spieltag | 20.04.2013 | York City | - | Southend United | 2:1 | ||||
| 46. Spieltag | 27.04.2013 | Dagenham & Redbridge | - | York City | 0:1 |
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