| 29. Spieltag | 28.01.2017 | Bolton Wanderers | - | Charlton Athletic | 1:2 |  |
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| 30. Spieltag | 04.02.2017 | Charlton Athletic | - | Fleetwood Town | 1:1 | |
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| 32. Spieltag | 14.02.2017 | Oldham Athletic | - | Charlton Athletic | 1:0 | ||||
| 26. Spieltag | 18.02.2017 | Rochdale AFC | - | Charlton Athletic | 3:3 | ||||
| 33. Spieltag | 21.02.2017 | Charlton Athletic | - | Oxford United | 0:1 | |
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| 34. Spieltag | 25.02.2017 | Charlton Athletic | - | Bury FC | 0:1 | ||||
| 38. Spieltag | 14.03.2017 | Charlton Athletic | - | Bradford City | 1:1 | ||||
| 39. Spieltag | 18.03.2017 | Sheffield United | - | Charlton Athletic | 2:1 | ||||
| 41. Spieltag | 01.04.2017 | Peterborough United | - | Charlton Athletic | 2:0 | ||||
| 40. Spieltag | 04.04.2017 | Charlton Athletic | - | Milton Keynes Dons | 0:2 | ||||
| 42. Spieltag | 08.04.2017 | Charlton Athletic | - | Southend United | 2:1 |  |
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| 43. Spieltag | 14.04.2017 | Coventry City | - | Charlton Athletic | 1:1 | ||||
| 44. Spieltag | 17.04.2017 | Charlton Athletic | - | Gillingham FC | 3:0 | ||||
| 45. Spieltag | 22.04.2017 | Chesterfield FC | - | Charlton Athletic | 1:2 | |
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| 46. Spieltag | 30.04.2017 | Charlton Athletic | - | Swindon Town | 3:0 | |
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