| 6. Spieltag | 15.09.2012 | Bradford City | - | Barnet FC | 3:0 | ||||
| 7. Spieltag | 18.09.2012 | Aldershot Town | - | Barnet FC | 1:0 | ||||
| 8. Spieltag | 22.09.2012 | Barnet FC | - | Rotherham United | 0:0 |  |
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| 9. Spieltag | 29.09.2012 | Fleetwood Town | - | Barnet FC | 2:1 | |
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| 10. Spieltag | 02.10.2012 | Barnet FC | - | Exeter City | 1:2 | ||||
| 11. Spieltag | 06.10.2012 | Southend United | - | Barnet FC | 2:2 | |
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| 12. Spieltag | 13.10.2012 | Barnet FC | - | Plymouth Argyle | 1:4 | ||||
| 13. Spieltag | 19.10.2012 | Barnet FC | - | Northampton Town | 4:0 |  |
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| 14. Spieltag | 23.10.2012 | Wycombe Wanderers | - | Barnet FC | 0:0 | ||||
| 15. Spieltag | 27.10.2012 | Chesterfield FC | - | Barnet FC | 0:1 | ||||
| 16. Spieltag | 06.11.2012 | Barnet FC | - | Torquay United | 1:0 | |
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| 17. Spieltag | 10.11.2012 | Morecambe FC | - | Barnet FC | 4:1 | |
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| 18. Spieltag | 16.11.2012 | Barnet FC | - | Accrington Stanley | 1:1 | ||||
| 19. Spieltag | 20.11.2012 | Barnet FC | - | Oxford United | 2:2 | ||||
| 20. Spieltag | 24.11.2012 | Cheltenham Town | - | Barnet FC | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 08.12.2012 | Barnet FC | - | AFC Wimbledon | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 15.12.2012 | Dagenham & Redbridge | - | Barnet FC | 1:0 | |
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