| 28. Spieltag | 13.01.2018 | Wycombe Wanderers | - | Colchester United | 3:1 | ||||
| 30. Spieltag | 27.01.2018 | Port Vale FC | - | Colchester United | 2:2 | ||||
| 31. Spieltag | 03.02.2018 | Colchester United | - | Newport County | 2:0 | ||||
| 32. Spieltag | 10.02.2018 | Carlisle United | - | Colchester United | 1:1 | ||||
| 33. Spieltag | 13.02.2018 | Colchester United | - | Coventry City | 2:1 | ||||
| 34. Spieltag | 17.02.2018 | Crewe Alexandra | - | Colchester United | 1:0 | ||||
| 38. Spieltag | 17.03.2018 | Colchester United | - | Yeovil Town | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 20.03.2018 | Morecambe FC | - | Colchester United | 0:0 | ||||
| 39. Spieltag | 24.03.2018 | Stevenage FC | - | Colchester United | 0:1 | ||||
| 40. Spieltag | 30.03.2018 | Colchester United | - | Luton Town | 2:1 |  |
|||
| 41. Spieltag | 02.04.2018 | Forest Green Rovers | - | Colchester United | 1:2 |  |
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| 42. Spieltag | 07.04.2018 | Colchester United | - | Accrington Stanley | 0:1 | ||||
| 43. Spieltag | 14.04.2018 | Colchester United | - | Notts County | 1:3 | ||||
| 44. Spieltag | 21.04.2018 | Lincoln City | - | Colchester United | 2:1 | ||||
| 45. Spieltag | 28.04.2018 | Colchester United | - | Swindon Town | 0:0 | ||||
| 46. Spieltag | 05.05.2018 | Exeter City | - | Colchester United | 1:0 |
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