| 12. Spieltag | 19.11.1999 | Hannover 96 | - | FC St. Pauli | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 26.11.1999 | 1. FC Köln | - | Hannover 96 | 3:1 | ||||
| 14. Spieltag | 03.12.1999 | Hannover 96 | - | Rot-Weiß Oberhausen | 1:1 | ||||
| 15. Spieltag | 10.12.1999 | SpVgg Greuther Fürth | - | Hannover 96 | 0:0 | ||||
| 21. Spieltag | 05.03.2000 | Hannover 96 | - | Kickers Offenbach | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 12.03.2000 | Fortuna Köln | - | Hannover 96 | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 17.03.2000 | Hannover 96 | - | 1. FSV Mainz 05 | 2:1 |  |
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| 24. Spieltag | 22.03.2000 | 1. FC Nürnberg | - | Hannover 96 | 5:1 | ||||
| 25. Spieltag | 31.03.2000 | Hannover 96 | - | Chemnitzer FC | 2:0 | |
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| 26. Spieltag | 07.04.2000 | Hannover 96 | - | Energie Cottbus | 3:2 | ||||
| 27. Spieltag | 16.04.2000 | Karlsruher SC | - | Hannover 96 | 1:3 | |
 |
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| 30. Spieltag | 08.05.2000 | Hannover 96 | - | 1. FC Köln | 3:5 | ||||
| 31. Spieltag | 12.05.2000 | Rot-Weiß Oberhausen | - | Hannover 96 | 2:1 | ||||
| 32. Spieltag | 18.05.2000 | Hannover 96 | - | SpVgg Greuther Fürth | 1:2 | ||||
| 33. Spieltag | 21.05.2000 | Stuttgarter Kickers | - | Hannover 96 | 2:1 | ||||
| 34. Spieltag | 26.05.2000 | Hannover 96 | - | VfL Bochum | 3:3 | |
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