| 1. Runde | 07.09.1988 | SSC Napoli | - | PAOK Saloniki | 1:0 | ||||
| 1. Runde | 05.10.1988 | PAOK Saloniki | - | SSC Napoli | 1:1 |  |
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| 2. Runde | 26.10.1988 | 1. FC Lokomotive Leipzig | - | SSC Napoli | 1:1 | ||||
| 2. Runde | 09.11.1988 | SSC Napoli | - | 1. FC Lokomotive Leipzig | 2:0 | ||||
| Achtelfinale | 23.11.1988 | Girondins Bordeaux | - | SSC Napoli | 0:1 | ||||
| Achtelfinale | 07.12.1988 | SSC Napoli | - | Girondins Bordeaux | 0:0 | ||||
| Viertelfinale | 28.02.1989 | Juventus | - | SSC Napoli | 2:0 | ||||
| Viertelfinale | 15.03.1989 | SSC Napoli | - | Juventus | 3:0 n.V. | ||||
| Halbfinale | 05.04.1989 | SSC Napoli | - | Bayern München | 2:0 | |
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| Halbfinale | 19.04.1989 | Bayern München | - | SSC Napoli | 2:2 | |
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| Finale | 03.05.1989 | SSC Napoli | - | VfB Stuttgart | 2:1 | |
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| Finale | 17.05.1989 | VfB Stuttgart | - | SSC Napoli | 3:3 | |
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