| 2. Spieltag | 04.08.2006 | Montpellier HSC | - | FC Gueugnon | 0:3 | ||||
| 3. Spieltag | 08.08.2006 | FC Gueugnon | - | Chamois Niortais | 0:1 | ||||
| 6. Spieltag | 25.08.2006 | EA Guingamp | - | FC Gueugnon | 6:1 |  |
|||
| 10. Spieltag | 29.09.2006 | Havre AC | - | FC Gueugnon | 6:1 | ||||
| 13. Spieltag | 27.10.2006 | FC Gueugnon | - | RC Strasbourg | 0:1 | ||||
| 17. Spieltag | 17.11.2006 | FC Libourne-Saint-Seurin | - | FC Gueugnon | 2:1 | ||||
| 20. Spieltag | 22.12.2006 | FC Gueugnon | - | Montpellier HSC | 3:0 | ||||
| 21. Spieltag | 12.01.2007 | Chamois Niortais | - | FC Gueugnon | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 26.01.2007 | FC Gueugnon | - | US Créteil-Lusitanos | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 02.02.2007 | Amiens SC | - | FC Gueugnon | 2:0 | ||||
| 25. Spieltag | 16.02.2007 | Tours FC | - | FC Gueugnon | 2:1 | ||||
| 28. Spieltag | 09.03.2007 | FC Gueugnon | - | Havre AC | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 30.03.2007 | FC Gueugnon | - | Grenoble Foot 38 | 0:0 | ||||
| 34. Spieltag | 30.04.2007 | SM Caen | - | FC Gueugnon | 1:1 | ||||
| 35. Spieltag | 04.05.2007 | FC Gueugnon | - | FC Libourne-Saint-Seurin | 1:3 | ||||
| 37. Spieltag | 18.05.2007 | FC Gueugnon | - | SC Bastia | 4:2 |
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