| 1. Spieltag | 28.07.2018 | FC Carl Zeiss Jena | - | SG Sonnenhof Großaspach | 3:2 | ||||
| 2. Spieltag | 04.08.2018 | Preußen Münster | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:2 | ||||
| 3. Spieltag | 07.08.2018 | FC Carl Zeiss Jena | - | Hallescher FC | 0:3 | ||||
| 4. Spieltag | 10.08.2018 | Karlsruher SC | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 | ||||
| 14. Spieltag | 03.11.2018 | FC Carl Zeiss Jena | - | Hansa Rostock | 1:1 | ||||
| 15. Spieltag | 12.11.2018 | SV Wehen Wiesbaden | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:3 | ||||
| 16. Spieltag | 24.11.2018 | FC Carl Zeiss Jena | - | SpVgg Unterhaching | 4:5 | ||||
| 18. Spieltag | 07.12.2018 | FC Carl Zeiss Jena | - | SV Meppen | 1:2 |  |
|||
| 20. Spieltag | 23.12.2018 | SG Sonnenhof Großaspach | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:0 | ||||
| 25. Spieltag | 23.02.2019 | FC Carl Zeiss Jena | - | Fortuna Köln | 0:1 | ||||
| 26. Spieltag | 03.03.2019 | FC Carl Zeiss Jena | - | Eintracht Braunschweig | 0:0 | ||||
| 28. Spieltag | 13.03.2019 | FC Carl Zeiss Jena | - | Sportfreunde Lotte | 1:1 |  |
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| 29. Spieltag | 16.03.2019 | VfL Osnabrück | - | FC Carl Zeiss Jena | 3:1 | |
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| 31. Spieltag | 31.03.2019 | VfR Aalen | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 |
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