| 2. Spieltag | 18.07.2008 | FC Wacker Innsbruck | - | Austria Wien (A) | 3:0 |  |
|||
| 3. Spieltag | 26.07.2008 | SKNV St. Pölten | - | FC Wacker Innsbruck | 3:3 | ||||
| 6. Spieltag | 23.08.2008 | FC Wacker Innsbruck | - | RB Salzburg (A) | 2:2 | ||||
| 9. Spieltag | 23.09.2008 | FC Wacker Innsbruck | - | DSV Leoben | 4:1 | ||||
| 10. Spieltag | 26.09.2008 | FC Lustenau | - | FC Wacker Innsbruck | 0:0 | ||||
| 12. Spieltag | 18.10.2008 | FC Wacker Innsbruck | - | FC Magna Wiener Neustadt | 1:1 | ||||
| 13. Spieltag | 24.10.2008 | Austria Wien (A) | - | FC Wacker Innsbruck | 4:1 |  |
|||
| 16. Spieltag | 11.11.2008 | FC Wacker Innsbruck | - | Austria Lustenau | 2:4 | ||||
| 17. Spieltag | 14.11.2008 | RB Salzburg (A) | - | FC Wacker Innsbruck | 2:2 | ||||
| 18. Spieltag | 22.11.2008 | FC Wacker Innsbruck | - | FC Trenkwalder Admira | 2:2 | ||||
| 19. Spieltag | 28.11.2008 | FC Wacker Innsbruck | - | FC Gratkorn | 2:0 | ||||
| 24. Spieltag | 03.04.2009 | Austria Lustenau | - | FC Wacker Innsbruck | 2:2 | ||||
| 31. Spieltag | 15.05.2009 | SV Grödig | - | FC Wacker Innsbruck | 2:3 | ||||
| 32. Spieltag | 19.05.2009 | FC Wacker Innsbruck | - | FC Trenkwalder Admira | 2:1 | ||||
| 33. Spieltag | 29.05.2009 | DSV Leoben | - | FC Wacker Innsbruck | 0:2 |
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