| 26. Spieltag | 17.01.2009 | Rotherham United | - | AFC Bournemouth | 1:0 | ||||
| 27. Spieltag | 24.01.2009 | Grimsby Town | - | Rotherham United | 3:0 | ||||
| 28. Spieltag | 27.01.2009 | Darlington FC | - | Rotherham United | 1:0 |  |
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| 29. Spieltag | 31.01.2009 | Rotherham United | - | Macclesfield Town | 2:0 | ||||
| 32. Spieltag | 14.02.2009 | Rotherham United | - | Gillingham FC | 2:0 | ||||
| 39. Spieltag | 21.03.2009 | Rotherham United | - | Chesterfield FC | 3:0 | ||||
| 30. Spieltag | 24.03.2009 | Rotherham United | - | Bury FC | 1:1 | ||||
| 40. Spieltag | 28.03.2009 | Rotherham United | - | Accrington Stanley | 0:0 | ||||
| 25. Spieltag | 31.03.2009 | Luton Town | - | Rotherham United | 2:4 | ||||
| 41. Spieltag | 04.04.2009 | Aldershot Town | - | Rotherham United | 0:1 | ||||
| 31. Spieltag | 07.04.2009 | Barnet FC | - | Rotherham United | 2:0 | ||||
| 44. Spieltag | 18.04.2009 | Rotherham United | - | Shrewsbury Town | 1:2 | ||||
| 35. Spieltag | 21.04.2009 | Rotherham United | - | Morecambe FC | 3:2 |  |
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| 45. Spieltag | 25.04.2009 | Bradford City | - | Rotherham United | 3:0 | ||||
| 46. Spieltag | 02.05.2009 | Rotherham United | - | Exeter City | 0:1 |
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