| 20. Spieltag | 30.01.1999 | Real Betis | - | CD Alavés | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 07.02.1999 | CD Alavés | - | Real Oviedo | 2:2 | ||||
| 22. Spieltag | 14.02.1999 | Real Zaragoza | - | CD Alavés | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 21.02.1999 | CD Alavés | - | CD Tenerife | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 28.02.1999 | Racing Santander | - | CD Alavés | 2:0 | ||||
| 25. Spieltag | 07.03.1999 | CD Alavés | - | RCD Mallorca | 2:0 | ||||
| 26. Spieltag | 14.03.1999 | CF Extremadura | - | CD Alavés | 1:0 | ||||
| 27. Spieltag | 21.03.1999 | CD Alavés | - | Atlético Madrid | 2:0 | ||||
| 28. Spieltag | 04.04.1999 | Real Madrid | - | CD Alavés | 3:2 | ||||
| 29. Spieltag | 11.04.1999 | CD Alavés | - | Deportivo La Coruña | 2:1 |  |
|||
| 30. Spieltag | 18.04.1999 | RC Celta | - | CD Alavés | 1:1 |  |
|||
| 31. Spieltag | 25.04.1999 | CD Alavés | - | Villarreal CF | 2:1 | ||||
| 32. Spieltag | 01.05.1999 | Valencia CF | - | CD Alavés | 5:0 | ||||
| 33. Spieltag | 09.05.1999 | CD Alavés | - | Real Valladolid | 2:0 | |
|||
| 35. Spieltag | 22.05.1999 | CD Alavés | - | FC Barcelona | 1:4 | ||||
| 36. Spieltag | 30.05.1999 | Espanyol Barcelona | - | CD Alavés | 3:0 | |
|||
| 37. Spieltag | 13.06.1999 | Athletic Club | - | CD Alavés | 5:0 | ||||
| 38. Spieltag | 20.06.1999 | CD Alavés | - | Real Sociedad | 2:1 |
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