| 1. Spieltag | 09.08.2003 | Tranmere Rovers | - | Brentford FC | 4:1 |  |
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| 2. Spieltag | 16.08.2003 | Hartlepool United | - | Tranmere Rovers | 0:0 | ||||
| 3. Spieltag | 23.08.2003 | Tranmere Rovers | - | Rushden & Diamonds FC | 1:2 | ||||
| 4. Spieltag | 25.08.2003 | Stockport County | - | Tranmere Rovers | 1:1 | ||||
| 5. Spieltag | 30.08.2003 | Tranmere Rovers | - | Colchester United | 1:1 | ||||
| 8. Spieltag | 16.09.2003 | Bristol City | - | Tranmere Rovers | 2:0 | ||||
| 9. Spieltag | 20.09.2003 | Notts County | - | Tranmere Rovers | 2:2 | ||||
| 10. Spieltag | 27.09.2003 | Tranmere Rovers | - | Wrexham AFC | 1:2 | ||||
| 11. Spieltag | 30.09.2003 | Tranmere Rovers | - | Wycombe Wanderers | 2:1 | ||||
| 12. Spieltag | 06.10.2003 | Luton Town | - | Tranmere Rovers | 3:1 | ||||
| 31. Spieltag | 17.02.2004 | Tranmere Rovers | - | Plymouth Argyle | 3:0 | ||||
| 32. Spieltag | 21.02.2004 | Oldham Athletic | - | Tranmere Rovers | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 24.02.2004 | Rushden & Diamonds FC | - | Tranmere Rovers | 2:1 | ||||
| 35. Spieltag | 10.03.2004 | Brighton & Hove Albion | - | Tranmere Rovers | 3:0 | ||||
| 36. Spieltag | 13.03.2004 | Tranmere Rovers | - | Chesterfield FC | 2:3 | ||||
| 39. Spieltag | 27.03.2004 | Tranmere Rovers | - | Notts County | 4:0 |
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