| 20. Spieltag | 09.02.2014 | 1. FC Köln | - | SC Paderborn 07 | 0:1 | ||||
| 24. Spieltag | 09.03.2014 | Karlsruher SC | - | SC Paderborn 07 | 4:0 |  |
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| 26. Spieltag | 21.03.2014 | 1. FC Union Berlin | - | SC Paderborn 07 | 1:1 | ||||
| 27. Spieltag | 25.03.2014 | SC Paderborn 07 | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
| 28. Spieltag | 30.03.2014 | FSV Frankfurt | - | SC Paderborn 07 | 1:3 | ||||
| 29. Spieltag | 04.04.2014 | SC Paderborn 07 | - | Fortuna Düsseldorf | 1:2 | ||||
| 30. Spieltag | 11.04.2014 | FC Ingolstadt 04 | - | SC Paderborn 07 | 1:2 | ||||
| 31. Spieltag | 20.04.2014 | SC Paderborn 07 | - | SpVgg Greuther Fürth | 2:2 |  |
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| 32. Spieltag | 27.04.2014 | SC Paderborn 07 | - | SV Sandhausen | 2:0 | |
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| 33. Spieltag | 04.05.2014 | Erzgebirge Aue | - | SC Paderborn 07 | 0:2 | ||||
| 34. Spieltag | 11.05.2014 | SC Paderborn 07 | - | VfR Aalen | 2:1 |
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