# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Flora, Estland FC Flora 9 7 2 0 24:4 20 23
2 FC Levadia, Estland FC Levadia 10 6 4 0 19:9 10 22
3 JK Nõmme Kalju, Estland JK Nõmme Kalju 9 5 2 2 18:9 9 17
4 FC Infonet, Estland FC Infonet 9 4 1 4 17:12 5 13
5 JK Narva Trans, Estland JK Narva Trans 10 3 2 5 15:19 -4 11
6 JK Sillamäe Kalev, Estland JK Sillamäe Kalev 14 3 2 9 17:33 -16 11
7 JK Tammeka, Estland JK Tammeka 10 2 3 5 11:20 -9 9
8 Paide Linnameeskond, Estland Paide Linnameeskond 10 2 3 5 10:23 -13 9
9 Tulevik Viljandi, Estland Tulevik Viljandi 9 1 0 8 4:36 -32 3
10 Pärnu JK Vaprus, Estland Pärnu JK Vaprus 10 1 0 9 9:42 -33 3
  Champions League Quali.
  Abstieg

# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus.

# JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest.