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| 28.09.2013 | 15:30 | FK Dukla Banská Bystrica | - | Spartak Myjava | 1:0 (0:0) | |
| 16:00 | Spartak Trnava | - | FK Senica | 1:0 (0:0) | ||
| 17:30 | FC Nitra | - | AS Trenčín | 1:1 (1:1) | ||
| 17:30 | Zlaté Moravce | - | MFK Košice | 1:1 (0:0) | ||
| 17:30 | MŠK Žilina | - | MFK Ružomberok | 2:3 (1:1) | ||
| 29.09.2013 | 14:30 | FC DAC 1904 | - | Slovan Bratislava | 1:2 (0:1) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Slovan Bratislava | 12 | 9 | 1 | 2 | 29:13 | 16 | 28 |
| 2 |
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MFK Ružomberok | 12 | 6 | 4 | 2 | 24:20 | 4 | 22 |
| 3 |
|
AS Trenčín | 12 | 6 | 2 | 4 | 30:15 | 15 | 20 |
| 4 |
|
Spartak Myjava | 12 | 6 | 2 | 4 | 21:19 | 2 | 20 |
| 5 |
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FK Senica | 12 | 5 | 4 | 3 | 18:12 | 6 | 19 |
| 6 |
|
Spartak Trnava | 12 | 6 | 1 | 5 | 17:19 | -2 | 19 |
| 7 |
|
FK Dukla Banská Bystrica | 12 | 4 | 5 | 3 | 21:15 | 6 | 17 |
| 8 |
|
MŠK Žilina | 12 | 4 | 4 | 4 | 22:20 | 2 | 16 |
| 9 |
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Zlaté Moravce | 12 | 4 | 3 | 5 | 12:20 | -8 | 15 |
| 10 |
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MFK Košice | 12 | 3 | 3 | 6 | 13:13 | 0 | 12 |
| 11 |
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FC Nitra | 12 | 1 | 3 | 8 | 13:31 | -18 | 6 |
| 12 |
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FC DAC 1904 | 12 | 1 | 2 | 9 | 7:30 | -23 | -1 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Abstieg |
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# Wegen der Verwicklung in einen Manipulationsskandal wurde DAC Dunajska Streda mit einer Zahlung von 10.000 Euro und einem Abzug von 6 Punkten am Ende der laufenden Saiso bestraft. |
