22.09.2012 REO Vilnius - FK Banga Gargždai 0:3 Wert.
14:00 FK Tauras Tauragė - FK Ekranas 0:2
16:00 VMFD Žalgiris - FK Kruoja Pakruojis 2:1
23.09.2012 14:00 FK Šiauliai - FK Sūduva 1:0
24.09.2012 17:00 FK Dainava Alytus - FK Atlantas 1:2
# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FK Ekranas, Litauen FK Ekranas 30 22 7 1 66:21 45 73
2 VMFD Žalgiris, Litauen VMFD Žalgiris 30 21 6 3 62:18 44 69
3 FK Sūduva, Litauen FK Sūduva 30 17 6 7 61:33 28 57
4 FK Kruoja Pakruojis, Litauen FK Kruoja Pakruojis 30 16 4 10 43:27 16 52
5 FK Šiauliai, Litauen FK Šiauliai 30 15 3 12 64:43 21 48
6 FK Banga Gargždai, Litauen FK Banga Gargždai 30 11 7 12 35:30 5 40
7 FK Dainava Alytus, Litauen FK Dainava Alytus 30 8 4 18 36:58 -22 28
8 FK Tauras Tauragė, Litauen FK Tauras Tauragė 30 6 2 22 28:76 -48 20
9 FK Atlantas, Litauen FK Atlantas 30 5 5 20 21:73 -52 20
10 REO Vilnius, Litauen REO Vilnius 30 5 4 21 26:63 -37 19
  Champions League Quali.
  Europa League Quali.
  Abstieg

# REO Vilnius zog sich nach dem 24. Spieltag aus finanziellen Gründen aus dem Spielbetrieb zurück. Alle ausstehenden Spiele wurden mit 0:3 gewertet.